指南宮之名是取「呂恩主在天庭居於南宮」、「濟世度人必須要指南針」之意，主要侍奉呂洞賓（呂恩主），俗稱「仙公廟」，目前已成為儒道釋三教同體的廟宇，被認為是臺灣道教聖地之一，也是指南地區主要的信仰。
有人說「多爬一個階梯，可以多活20秒」，假如真是這樣的話，也許到指南宮一趟，就可以增加十個小時的壽命！指南宮位臺北市南邊靠近政大的山丘上，建於西元1891年，供奉孚祐帝君，即八仙中的呂洞賓，傳說仙公呂洞賓自從得道成仙以後，就時常來到人間，普渡眾生，所以在民間信仰中，是一位很得人緣的神。
指南宮位在猴山上，所以可經由車道或山後的小路上去。小路上約有1200級的石階，階旁有很多石柱，柱頂可裝油燈，是日治時期信徒所捐獻的石燈籠。每走百餘階，就有平台可供休息。經過山門來到拜殿，可看見一對龍柱，龍頭向上翹起。進入殿內，向圍著紅色欄杆內的神龕地上仔細看，會發現有盤龍吐珠的「龍陛」。繞過鼓樓，來到孚祐帝君大殿，是三層樓的建築，一樓是香客房，提供夜宿，也就是以前的祈夢室。在當時，假如信徒有所祈求，而且得到呂仙公的同意住進祈夢室，那麼就可以在夜夢中得到指點。
循著仙公廟後的左側小徑，可到達大雄寶殿。2、3樓是正殿，供奉釋迦牟尼佛，其中有一尊是泰國巴博元帥惠贈的泰國國寶－釋迦牟尼金佛，是參照印度科達時代的印度佛像形態，由九種金屬礦石精工鑄成，是該廟最特別的一尊佛像。從仙公廟後的右側小徑，順著景色怡人的斜坡廊道直走，就可來到凌霄寶殿。天兵天將護衛在門簷上，殿內有許多神佛，顯得莊嚴肅穆。沿寶殿左側走道過去，是指南觀光樂園，視野遼闊。旁邊有露營場，兩地之間有山路通孔子殿，殿外有白牆，牆上有孔子和弟子周遊列國的浮雕，並環繞一雙麒麟，象徵孔子的精神，就像鳳毛麟角般珍貴。
這座中式的廟宇建築，金碧輝煌、莊嚴肅穆，區內主建築包括凌霄寶殿、大雄寶殿、大成殿，另設有禪房、靜室、祈夢室等；凌霄寶殿建築富麗宏徫，雕繪巧奪天成，頗有氣宇軒昂的氣概。大雄寶殿位在正殿後方，供奉泰國佛祠，金黃色圓頂建築，四周有數座佛像盤腳跌坐，是指南宮最具雄偉的建築。大成殿在指南樂園的後方，殿內供奉孔子、孟子、曾子及堯舜三官大帝，廟宇莊嚴肅穆，蔚為儒、道、釋三教合一的宗教勝地，也是我國建築藝術的代表。指南宮神明靈驗，因此信徒廣增，香火一向鼎盛，尤其祭祀節日，總見來自各地的善男信女至此進香，人潮將寺廟擠的水洩不通，如今，指南宮已發展成為觀光勝地。
另外還有奉祀土地公的福德祠，沿著石階往上走可到指南宮迴廊，便可一覽木柵觀光茶園的景觀。因為汽機車無法開進指南宮，入口備有小型接駁車，提供給行動不便或者是年長人士搭乘。
另外，有件事值得一提，據說呂洞賓當年追求不到八仙中唯一的女性－何仙姑，因此會嫉妒在一起的情侶。所以大部份的情侶都不敢同時去指南宮，以防被拆散。